En 1944, Ofèlia i sa mare es traslladen a un poblet del nord d'Espanya per reunir-se amb el padrastre de la jove, un capità tirà i sanguinari que comanda un destacament de soldats amb la missió de desfer-se dels maquis que s'amaguen a la muntanya. En arribar, guiada per un estrany insecte que pren per una fada, Ofèlia descobreix un estrany laberint en runes, on coneixerà el faune, una criatura màgica que li assegura que ella és la princesa d'un món subterrani que fa centenars d'anys es va perdre a la Terra i que, finalment, pot tornar a casa. Abans, però, haurà de superar tres proves...
